새날 교회는 하나님께서 주신 사명을 위해 교육과 훈련, 예배와 찬양, 선교와 구제, 친교를 위한 각종 부서 모임들을 운영하고 있습니다. 

1. 교육부서 (장년, 청년, 중고등부, 아동부)
2. 선교와 구제부
3. 예배를 위한 성가대와 찬양대​
4. 친교를 위한 각종 동아리 모임 (축구, 바둑, 기타, 골프)